1．变电站自动化系统的技术标准问题
    变电站自动化系统的技术标准包括技术标准、自动化系统模式及管理标准等。目前都还没有统一的标准。
    2．生产厂家的问题
    目前，变电站自动化系统大多还存在有系统功能不全面，产品质量不合格，性能指标达不到要求的情况。加之生产厂家过分重视经济利益，用户过分追求技术含量，导致系统设计漏洞较多。
    3．不同产品的接口问题
    由于变电站自动化系统由许多功能模块组成，故不同厂家的产品需要在数据接口方面沟通。
    4．传输规约和传输网络选择的问题
   实现传输规约和传输网络的标准化，才能真正实现变电站自动化系统内部设备的互换性。
    5．变电站自动化系统的开放性问题
    变电站自动化系统应能实现不同厂家设备的互换性以避免各厂家重复开发，浪费人力物力。
    6．变电站自动化系统组织模式选择问题
    变电站自动化系统组织模式目前主要有集中式、分散与集中相结合和全分散式三种类型。